Фамилия Кулюпанова — женская форма фамилии Кулюпанов. Её основа — прозвище Кулюпан, которое, скорее всего, связано с диалектным словом «кулюпать». В русских говорах, особенно на Урале и в Сибири, «кулюпать» означало «месить что-то жидкое, пачкать, возиться с грязью», а также «делать что-то неловко, неумело». Соответственно, Кулюпаном могли назвать человека неаккуратного, медлительного, либо того, чья работа была связана с грязью или вязкой массой (например, гончара, печника, мельника или просто неряшливого крестьянина).

Словообразовательная модель здесь нестандартная. В отличие от типичных отчеств на -ов/-ев, фамилия Кулюпанов образована напрямую от прозвища с суффиксом -ан-. Такая модель (ср. Болван — Болванов, Гулян — Гулянов) характерна для прозвищ, которые закрепились в качестве родового имени без промежуточной формы отчества. Это указывает на то, что прозвище было очень устойчивым и, возможно, передалось от отца к сыну как фамильное ещё в допетровскую эпоху.

Версия о связи с тюркскими корнями (например, от имени Кулюп или «кул» — раб, слуга) менее правдоподобна. Фамилия не встречается в регионах с сильным татарским или башкирским влиянием, а глагольная основа «кулюпать» даёт более прямое и логичное объяснение. Кроме того, в русских говорах слово «кулюпа» могло обозначать и вид растения, но это значение локально и не даёт убедительного прозвищного смысла.

Фамилия Кулюпанова — редкая. Встречается преимущественно в Зауралье и на юге Тюменской области, что косвенно подтверждает её диалектное происхождение. Носительница фамилии может с высокой вероятностью считать своими предками крестьян-старожилов Сибири, чьё прозвище было дано по характерной черте характера или роду занятий.