Фамилия Колюпанов образована от прозвища Колюпан, которое, скорее всего, восходит к глаголу «колупать», то есть «ковырять, крошить, отдирать». Согласно этому, прозвище Колюпан мог получить человек, который неаккуратно ел. По другой версии, прозвище Колюпан восходит к нарицательному «колупа» со значением «хмурый, вялый человек». В таком случае прозвище Колюпан указывало на особенности характера предка. Так и прозвище Колюпан закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Колюпанов. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Колюпан, со временем получил фамилию Колюпанов.