Фамилия Кусербаев — классический пример фамилии на -ев, образованной от тюркского имени. В основе лежит мужское личное имя Кусербай. Как и большинство подобных фамилий у тюркских народов, она оформилась в русской среде через добавление патронимического суффикса, указывающего на принадлежность: «чей?» — Кусербаев, то есть сын Кусербая.

Само имя Кусербай составное. Первая часть, «Кусер» (или «Кусяр»), восходит к арабскому слову «кусар» — один из эпитетов, означающих «малый», «короткий», или может быть вариантом имени Хусейн (уменьшительная форма от Хасан, «красивый»). В тюркских языках этот корень нередко становился частью имени, подчеркивая скромность или молодость. Вторая часть — «бай» — классический тюркский титул, означающий «господин», «богач», «хозяин». Соединяясь, имя Кусербай можно перевести как «маленький господин» или «младший бай» — такое имя давали младшему сыну или ребенку, желая ему достатка, но без излишней гордости.

Географически фамилия Кусербаев тяготеет к башкирской и татарской среде, встречается у казахов. Это не случайно: составные имена с компонентом «бай» типичны именно для этих народов. В отличие от чисто арабских имен, такие конструкции приживались в кочевой и полукочевой среде, где титул «бай» имел конкретный социальный вес. Предки носителей фамилии, вероятно, были людьми свободного сословия, но не знатного происхождения — имя «маленький бай» как раз и ограничивает амбиции.

Любопытная деталь: в русских документах фамилия могла записываться по-разному — через «с» или «з», с одним или двумя «с» на стыке. Вариант Кусербаев (а не, скажем, Кузербаев) закрепился, скорее всего, под влиянием башкирского произношения, где глухой звук в начале корня сохраняется устойчиво. Встречается и форма Кусербаев — с ударением, как правило, на последний слог, что тоже выдает тюркский ритмический рисунок.