Фамилия Кущикова — женская форма мужской фамилии Кущиков, и её происхождение стоит искать в прозвище или мирском имени, а не в географическом названии. В основе лежит слово «кущик», которое может быть уменьшительной формой от «куст» или от диалектного «куща» — густая заросль, чаща, а в некоторых говорах так называли шалаш или временное укрытие из веток. Скорее всего, прозвище Кущик дали человеку, жившему в лесистой, заросшей местности, или тому, кто сооружал такие шалаши — охотнику, пастуху, леснику.

Модель образования типична для русских фамилий: суффикс -ов/-ев присоединялся к основе на согласный, прибавляя значение принадлежности. «Кущиков» буквально означает «сын Кущика» или «из семьи Кущика». Фамилия могла возникнуть в северных и центральных областях России, где слово «куща» было в ходу, но встречается и в южных регионах, где кустарниковые заросли называли «кущи». Интересно, что в некоторых старых документах фиксировалась форма «Кущиков» как вариант отчества от прозвища «Куща», что также возможно — тогда основа была бы не уменьшительной, а прямой.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Кустов, Кустиков, Кущев — показывает, что Кущиков стоит особняком: суффикс -ик- в основе указывает на конкретное, возможно, ироничное или ласкательное прозвище, а не на родовой признак. В отличие от Кустова, который мог быть просто от «куст», Кущик — более личное, бытовое именование. Сословная принадлежность носителей не закреплена: Кущиковы могли быть и крестьянами, и мещанами, и казаками — фамилия не указывает на дворянство или духовенство. Встречаемость фамилии невысокая, что подтверждает её локальный характер: она редкая даже для русских фамилий, и в современных справочниках её носители фиксируются в основном в Поволжье и на Урале.