Фамилия Кушкумбаев происходит от сложного тюркского имени Кушкумбай. В основе лежат три компонента. Первый — «куш», что означает «двойной, парный»: такое имя давали мальчику с пожеланием создать крепкую семью и найти вторую половинку. Второй элемент — «кум» («песок»), возможно, указывал на место рождения в пустыне. Третий — «бай», то есть «хозяин, богатый человек, господин». Родители, называя сына Кушкумбаем, желали ему одновременно и богатства с влиянием, и семейного счастья.

Сами Кушкумбаевы — это русифицированная форма фамилии, образованная через патронимический суффикс -ев: от имени отца Кушкумбай. Модель типична для русской традиции, но основа выдает восточные корни. Наиболее вероятно, что родоначальник фамилии был тюрком по происхождению — выходцем из Золотой Орды, печенежских или половецких степей. Сведения о восточном корне фамилии подтверждаются самим именем, которое несет явную тюркскую семантику.

Проникновение таких фамилий в русскую среду объясняется исторически: в XV–XVII веках многие тюркские кочевники переходили на службу к русским князьям и царям. Часть из них получала дворянство, и их потомки постепенно встраивались в российскую сословную систему. Однако фамилия Кушкумбаев осталась памятником восточной письменности и культуры, сохранив в себе звучание степных языков и древние пожелания предков.