Фамилия Кутлугузина — одна из тех, что сразу выдают тюркские корни. В основе лежит составное имя Кутлугузя, которое до сих пор встречается у башкир и татар. Первая часть, «кутлу», восходит к древнетюркскому «кут» — счастье, удача, благодать. В тюркской мифологии кут — это особая жизненная сила, ниспосланная небом. Вторая часть, «гузя», — это, скорее всего, вариант имени Гузя или слова «гуз» в значении «глаз» или «взгляд». Таким образом, Кутлугузя можно перевести как «счастливый взгляд» или «отмеченный удачей». Имя давали в надежде, что ребенок принесет в дом благополучие.

Окончание -ина указывает на принадлежность по женской линии, но в русской традиции это стандартная форма фамилии для женщин. Мужской вариант — Кутлугузин. Фамилия образована от имени отца или основателя рода, то есть предка носительницы звали Кутлугузя. Это типичная патронимическая модель для народов Поволжья и Урала, где русский суффикс -ин присоединялся к тюркским основам.

Географически фамилия Кутлугузина распространена в Башкортостане, Татарстане, а также в Оренбургской и Челябинской областях. Встречается она и у мишарей (татар-мишарей). Социально носители фамилии в XIX — начале XX века относились к крестьянам или мещанам, но из-за того, что имя Кутлугузя было довольно распространённым у башкир, часть предков могла быть из сословия башкир-вотчинников, владевших землёй.

С точки зрения словообразования фамилия интересна тем, что сохранила архаичный компонент «кут», который в современном татарском и башкирском языках почти вышел из употребления в именах, зато остался в фамилиях. Встречаются однокоренные варианты: Кутлуков, Кутлубаев, Кутлугильдин, но Кутлугузина стоит особняком из-за редкой второй части. Никаких альтернативных версий происхождения, например от прозвища или профессии, у этой фамилии нет — она однозначно восходит к личному имени.