Фамилия Кутлин в своей основе восходит к мужскому имени Кутлы. Это имя имеет древнетюркско-татарское происхождение и переводится на русский язык как «счастливый, приносящий счастье», «живой, здоровый, благополучный», «достойный похвалы». Родители, нарекая ребенка таким именем, желали ему долгой, радостной, беззаботной жизни. Потомок человека по имени Кутлы со временем и получил фамилию Кутлин.

По своей словообразовательной модели фамилия относится к самому распространённому типу русских фамилий — на -ин. Суффикс -ин присоединялся к основам, оканчивающимся на -а или -я. В данном случае имя Кутлы (в русском произношении оно могло звучать как Кутла) дало форму притяжательного прилагательного: «чей?» — Кутлин, то есть сын Кутлы.

Интересно, что имя Кутлы (Кутлуг) было широко распространено в тюркской среде и встречается в исторических документах. Например, в родословных знатных татарских родов упоминается князь Кутлуг-Буга. Однако фамилия Кутлин — это уже русская адаптация: тюркское имя «обрусело» и оформилось по законам русской грамматики.

Менее вероятная, но возможная версия связывает фамилию с устаревшим диалектным словом «кутла» — так в некоторых говорах называли неуклюжего, неповоротливого человека. В этом случае прозвище Кутла могло закрепиться за человеком по внешнему признаку. Но эта гипотеза уступает первой по степени распространённости: тюркские корни у фамилии прослеживаются чётче, особенно если учесть, что в основе лежит имя, а не прозвище.

Фамилия Кутлин встречается в Поволжье и на Урале — в регионах, где веками соседствовали славянские и тюркские народы. Это косвенно подтверждает её происхождение от тюркского имени. Встречаются также варианты Кутлинов и Кутлынин, но основная форма — Кутлин — наиболее частотна.