Фамилия Куттубаев образована от мужского имени Куттубай. Имя это составное, тюркское, и его части многое говорят о том, как в степи относились к человеку. Первая часть — «кутту» — означает «счастливый, приносящий счастье». Вторая — «бай» — переводится как «хозяин, богатый, состоятельный, могущественный человек, господин». Вместе имя Куттубай можно понять как «приносящий счастье господин» или «счастливый богач». Это не просто пожелание, а скорее характеристика, которую давали ребенку, надеясь на его удачливую и обеспеченную судьбу.

Модель образования фамилии проста и типична для тюркских народов, оказавшихся в составе Российской империи. К основе на -ай добавили русский патронимический суффикс -ев (фонетический вариант -ов после мягкого согласного). Так появилась фамилия, означающая «сын Куттубая». Подобных фамилий с корнем «кут» (счастье, удача) у тюркских народов много: Кутузов, Кутуев, Кутлубаев, Кутдусов. Все они восходят к одному смысловому полю, где имя должно было привлечь к человеку благополучие.

Географически фамилия Куттубаев чаще всего встречается среди казахов и башкир, реже — у татар. В казахском ономастиконе имя Куттубай известно давно, и фамилия на -ев закрепилась за потомками в XIX веке, когда начался массовый учет населения. В отличие от русских фамилий на -ин, которые указывали на принадлежность матери (если основа оканчивалась на -а), Куттубаев строго патронимична: она отсылает к отцу, а не к роду занятий или месту жительства.

Стоит упомянуть, что в некоторых тюркских языках слово «кут» имеет еще и сакральный оттенок — не просто счастье, а божественная благодать, удача, ниспосланная свыше. Поэтому имя Куттубай могло восприниматься не только как бытовое пожелание богатства, но и как знак особого расположения судьбы. Таким образом, носитель фамилии Куттубаев — потомок человека, которого в своем кругу считали не просто состоятельным, но и отмеченным удачей.