Фамилия Кузёмин — один из тех случаев, когда народная речь перекроила церковное имя до неузнаваемости, а потом закрепила результат в официальном документе. В основе лежит имя Кузёма, которое в русских говорах возникло как просторечный вариант канонического имени Косма (через форму Кузьма). Имя это греческое, от слова «косма» — «мир, порядок, мироздание», но в быту его осмысляли проще: как имя святого Космы, покровителя ремёсел.

Если взглянуть на словообразовательную модель, фамилия построена по стандартной схеме с суффиксом -ин, который в русском языке указывает на принадлежность: «чей?» — Кузёмин, то есть сын Кузёмы. Такая модель типична для фамилий, образованных от имён, оканчивающихся на -а, -я. Интересно, что в одних и тех же семьях могли одновременно бытовать формы Кузьмин, Кузёмин и даже Козьмин — разница зависела от того, как местный говор адаптировал греческое имя.

С точки зрения социального контекста, носители фамилии Кузёмин — в основном выходцы из крестьянской и мещанской среды центральных и южнорусских губерний. Фамилия недворянская, но и не редкая: её фиксируют переписные книги XVII–XVIII веков, особенно в Рязанской, Тамбовской и Воронежской губерниях. В этих краях имя Кузьма было одним из самых ходовых, и его уменьшительная форма Кузёма встречалась в быту повсеместно.

Отдельно стоит сказать о написании. В современных справочниках фамилию часто путают с Куземиным (от имени Кузьма) или путают ударение. В исконном варианте Кузёмин ударение падает на второй слог, что сохраняет связь с исходным именем Кузёма. Если же произносить с ударением на последний слог — это уже влияние фамилий на -ин, где ударение сместилось по аналогии с соседними формами.

Итог простой: фамилия Кузёмин — это прямой потомок крестильного имени Косма, прошедшего через народную переработку. Ваш предок, скорее всего, был человеком по имени Кузёма, и его дети записались как Кузёмины. Никакой тайны или редкого корня тут нет, зато есть живой след того, как в русской деревне перекраивали греческие имена на свой лад.