Фамилия Кужамбаев — из числа тех, что безошибочно указывают на тюркские корни, а точнее — на казахскую или башкирскую среду. Её основа — мужское личное имя Кужамбай, которое сложено из двух компонентов. Первая часть, «Кужа», восходит к персидскому «ходжа» — господин, хозяин, почтенный человек, а в религиозном контексте — тот, кто совершил хадж. Вторая часть, «бай», — древний тюркский титул, означающий богатого, влиятельного человека, главу рода. В сумме имя Кужамбай можно перевести как «господин-богач» или «почтенный бай».

Русский суффикс -ев, присоединённый к основе, — стандартный способ адаптации тюркских фамилий в документах Российской империи и СССР. Он отвечает на вопрос «чей?»: Кужамбаев — сын Кужамбая. Такая модель образования — самая распространённая для фамилий из Поволжья, Приуралья и Казахстана, где фиксация отчества в качестве родового имени стала нормой в XIX–XX веках.

Интересно, что имя Кужамбай не является случайным или редким — в казахском именослове есть целая группа имён с тем же корнем: Кужахмет, Кужан, Кужак. Все они указывают на связь с исламской традицией и социальным статусом. Поэтому предки носителя фамилии Кужамбаев, скорее всего, были людьми уважаемыми, возможно, зажиточными скотоводами или торговцами, а не рядовыми общинниками. Фамилия не даёт точных сведений о сословии, но её семантика говорит о том, что основатель рода носил имя, подчёркивающее достоинство и вес в обществе.

Географически фамилия Кужамбаев встречается преимущественно в Западном Казахстане (Актюбинская, Западно-Казахстанская области), а также среди казахских диаспор в России — в Оренбургской, Астраханской областях. Встречаются варианты написания с буквой «а» в конце основы — Кужамбаев, — что связано с особенностями передачи казахских окончаний в русской записи.