Фамилия Кузюшкин образована по редкой и интересной модели — с помощью двойного суффикса, что сразу выдаёт нетипичное происхождение. В русских фамилиях чаще встречаются суффиксы -ов/-ев, -ин, -ский. Здесь же мы видим цепочку: корень КУЗ- → суффикс -юшк- (уменьшительно-ласкательный, как в словах «батюшка», «дедушка») → фамильный суффикс -ин. Получается, что Кузюшкин буквально означает «чей?» — отпрыск или человек, относящийся к Кузюшке.

Кузюшка — это народная, ласковая форма крестильного имени Козьма (в просторечии — Кузьма). Имя это греческого происхождения, означает «украшение», «мир». В русской деревне Кузьма было одним из самых распространённых имён, особенно в среде крестьян и ремесленников. От него образовалась целая россыпь фамилий: Кузьмин, Кузмин, Кузьмичёв, Кузнецов (через прозвище Кузнец, но корень тот же — кузнечное ремесло, связанное с именем). Кузюшкин стоит в этом ряду особняком: оно не от «Кузьмы» напрямую, а от его ласкательного варианта, что говорит о домашнем, неформальном прозвище предка.

Вероятно, первого носителя прозвища Кузюшка в семье называли так в быту, отличая от других Кузьм. Позже это прозвище закрепилось за его детьми уже как фамилия. Географически фамилия Кузюшкин тяготеет к северным и центральным регионам России — встречается в архивных записях по Вологодской, Костромской и Кировской областям. В этих местах были сильны традиции уменьшительных форм имён, и суффикс -юшк- встречается чаще, чем в южнорусских говорах.

Таким образом, Кузюшкин — не просто «сын Кузьмы», а «внук того, кого дома звали Кузюшкой». Фамилия сохранила в себе тепло деревенского обихода, где полное имя использовали реже, чем ласковое прозвище. Никакого отношения к слову «кузя» (в значении «друг» или «жук») она не имеет — это чисто ономастическая случайность.