Фамилия Квачанова — редкий случай, когда географическая привязка проясняет происхождение быстрее, чем разбор корня. В основе лежит прозвище или некалендарное имя Квачан. Если смотреть на карту распространения, основной ареал фамилии — юг России и Украина, особенно Краснодарский край, Ростовская область, а также бывшие казачьи территории. Это наводит на мысль, что Квачан — не славянское имя из святцев, а местное, диалектное слово.

Корень «квач» в южнорусских и украинских говорах означает нечто мокрое, размокшее, киселеобразное. Отсюда «квача» — каша или месиво, а «квач» — малярная кисть или тряпка для смазки (например, колёс дёгтем). В переносном смысле Квачаном могли прозвать человека неопрятного, вечно чумазого, либо, наоборот, маляра или бондаря, который часто возился с жидкими составами. Вторая, менее очевидная версия: Квачан — это вариант имени Кочан (от «кочан капусты»), которое в южных говорах звучало как «квачан» из-за аканья и смягчения. Тогда прозвище относилось к человеку плотному, коренастому.

Суффикс «-ан» образует прозвища в украинской и южнорусской традиции (сравните: Голован — большеголовый, Усан — усатый). Фамилия Квачанов закрепилась с типичным русским патронимическим суффиксом «-ов», указывающим на принадлежность: «сын Квачана». Форма Квачанова (женская) и Квачанов (мужская) — это одна и та же фамилия, различающаяся только грамматическим родом, что характерно для русской ономастики.

Сословный состав носителей неоднороден. В дореволюционных записях Квачановы встречаются среди казаков и государственных крестьян южных губерний, реже — среди мещан. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. Фамилия нечастотная, но устойчивая: она не исчезла и не трансформировалась, как это бывает с редкими прозвищами, а сохранилась в основном на своей исторической территории — в чернозёмной полосе и Приазовье.