Фамилия Квтун — редкая и необычная для русского уха. Её происхождение вызывает вопросы, поскольку в ней нет типичных для русских фамилий суффиксов (-ов, -ин, -ский). Скорее всего, перед нами украинская или белорусская фамилия, образованная от прозвища без дополнительного оформления. В украинской и белорусской традиции распространены «чистые» основы, которые становились фамилиями напрямую.

Корень «квт-» не является очевидным. Самая правдоподобная версия связывает фамилию с глаголом «квiтнути» (украинское «цвести»). В таком случае Квтун — это человек, связанный с цветением, возможно, садовод, пасечник (цветы — основа для мёда) или просто прозвище цветущего, здорового человека. Менее вероятно, но возможно, что основа восходит к диалектному «квiт» в значении «квитанция», «расписка» — тогда прозвище мог получить писарь или сборщик податей.

Суффикс -ун в украинских фамилиях часто указывает на деятеля, носителя характерного признака (ср. Брехун, Скакун). То есть Квтун — «тот, кто цветёт» или «цветущий». Фамилия могла закрепиться в центральных и западных областях Украины, где распространены подобные модели. В русских говорах слово «квтун» не фиксируется, что ещё раз подтверждает её западнорусское или украинское происхождение.

Встречаются и единичные случаи написания через «х» — Хвтун, что может указывать на южнорусское или украинское «хв» вместо «кв» (например, «хвiтка» вместо «квiтка»). Однако вариант Квтун — основной.

Таким образом, носитель фамилии Квтун, скорее всего, потомок украинского или белорусского крестьянина, получившего прозвище за цветущий вид или занятие, связанное с садами и цветами. Фамилия сохранила архаичную форму без суффикса принадлежности, что делает её особенно интересной для историков языка.