Фамилия Коовтун — редкий случай, когда написание расходится с произношением настолько, что корень перестаёт узнаваться. На слух это, скорее всего, «Ковтун», и именно так фамилию произносят. Двойное «о» в начале — либо результат канцелярской ошибки при записи, либо сознательное искажение, чтобы отличаться от многочисленных однофамильцев. В любом случае, основа здесь та же, что и у фамилии Ковтун.

В основе лежит прозвище Ковтун. В южнорусских и украинских говорах так называли человека с нечёсаными, свалявшимися волосами — «ковтуном». В народной медицине ковтун считался болезнью, которую насылали злые силы, и обладатель такого прозвища мог слыть не только неряшливым, но и «порченым», отмеченным нечистой силой. Однако не стоит воспринимать это прозвище как однозначно обидное: в крестьянской среде, где за внешностью следили редко, подобное имя-прозвище могло закрепиться за человеком просто как отличительная черта, без злого умысла.

Словообразовательная модель простейшая: к основе «ковтун» добавился нулевой суффикс, и фамилия застыла в форме прозвища. Обычно такие фамилии (Ковтун, Шевченко, Гончар) типичны для украинской и южнорусской традиции, где патронимические суффиксы -ов/-ев или -ин часто опускали. Носитель фамилии Коовтун — почти наверняка потомок человека, которого когда-то прозвали Ковтуном.

Географически фамилия Ковтун (и её варианты) распространена на Украине, в Беларуси и в южных областях России. Коовтун — штучный, вероятно, локальный вариант, который мог возникнуть в результате метания писаря между «Ковтун» и «Кавтун» (диалектное произношение). Если вы носите эту фамилию, то, скорее всего, ваши предки — казаки или крестьяне с Левобережной Украины или Черноземья. Дворянских корней у этой фамилии нет: прозвище слишком бытовое, чтобы попасть в гербовники.

Сравнение с однокоренными фамилиями показывает, что Коовтун — не единственное искажение. Встречаются Кавтун, Ковтунов, Ковтуненко. Но именно двойное «о» — самая редкая и запутанная форма, которая делает фамилию почти уникальной.