Фамилия Лапируза — редкий случай в русском ономастиконе, и её происхождение почти наверняка не связано с русским языком напрямую. Если отбросить маловероятные версии о случайном совпадении звуков, наиболее правдоподобное объяснение лежит в области географических названий или заимствованных прозвищ.

Первое, что бросается в глаза: основа «Лапируз» не имеет славянских корней. В русском языке нет слова «лапируза» или «лапирус», которое могло бы стать прозвищем по профессии, внешности или характеру. Суффикс -а в конце указывает на то, что это, скорее всего, русифицированная форма иностранной фамилии, адаптированная под женский род (как «Шмидт» → «Шмидта») или застывшая в форме родительного падежа. Однако для русского уха фамилия звучит как прилагательное женского рода, что нетипично для исконных фамилий на -а (обычно это -ин, -ова, -ская).

Самая сильная версия — связь с французским топонимом или фамилией Лаперуз (La Pérouse). Знаменитый мореплаватель Жан-Франсуа де Лаперуз, именем которого назван пролив между Сахалином и Хоккайдо, мог оставить след в российской истории. В XVIII–XIX веках, особенно после экспедиции Лаперуза (1785–1788), его фамилия могла попасть в Россию несколькими путями: как прозвище, данное моряку или путешественнику, как фамилия обрусевшего француза (например, гувернёра или офицера), или как искусственное «географическое» прозвище для крепостного, принадлежавшего помещику, увлекавшемуся мореплаванием. Форма Лапируза — это типичная русская переделка французского произношения: ухо слышало «Лаперуз», а записывало на слух «Лапируза», с заменой «е» на «и» (аканье) и добавлением окончания по аналогии с русскими фамилиями.

Менее вероятная, но допустимая версия — происхождение от итальянского слова «lapirussa» (красный камень) или от названия растения, но такие гипотезы не подкреплены ни распространённостью фамилии, ни историческими документами. В любом случае, фамилия Лапируза — штучная, нетипичная для крестьянской среды, и её носители, скорее всего, были людьми, так или иначе связанными с морским делом, иностранцами или образованным сословием. Географически такие фамилии чаще встречаются в портовых городах или в местах, куда ссылали иностранных специалистов.