Основой фамилии Лапонкина послужило церковное имя Евлампий и Харлампий. Фамилия Лапонкин, вероятно, ведет свое начало от имени Лапонка, которое представляет собой уменьшительную форму нередких в старину имен Евлампий и Харлампий, имеющих греческое происхождение. Имя Евлампий означает «благосветный», а Харлампий - «светящийся радостью». Скорее всего, основатель рода Лапонкиных был человеком из простого сословия. Согласно другой, менее правдоподобной версии, фамилия Лапонкин образована от дохристианского личного имени Лапонка — ласкового обращения к милому, любимому человеку (однокоренными являются «лапа», «лапушка», «лапонька»).