Фамилия Лапырис образована от прозвища Лапырь, и её объяснение уходит корнями в народную речь. В основе, скорее всего, лежит диалектное слово «лопырь» — так в некоторых областях называют мальков широкотелых карповых рыб (белоглазки, густеры, синца). Если принять эту версию, то Лапырем могли прозвать рыболова — человека, который знал толк в ловле мелкой рыбы или торговал ею. Чередование гласных о/а в корне (лопырь → лапырь) — явление обычное для акающих говоров, где безударное «о» звучит как «а».

Есть и другая гипотеза, которая связывает прозвище Лапырь с глаголом «лопать». В литературном языке это слово значит «разрывать», но в диалектах его смысл куда шире. В олонецких говорах «лопать» — «кричать изо всех сил», в вятских — «бить». Если основатель рода получил прозвище по этому глаголу, то он мог отличаться громким голосом, физической силой или вспыльчивым нравом.

Фамилия Лапырис звучит необычно для русского уха. Суффикс -ис скорее указывает на западное влияние: такие модели фамилий нередко встречались на землях, входивших в Великое княжество Литовское и Речь Посполитую. Возможно, славянская основа прозвища закрепилась в форме с этим суффиксом именно в тех краях.

По документам фамилия встречается в списках участников Великой Отечественной войны. Например, в Иркутской области значится Виктор Леонтьевич Лапырис, родившийся 15 октября 1927 года, а в Смоленской области — Виктор Митрофанович Лапырис, родившийся 24 апреля 1920 года. Эти записи подтверждают, что фамилия бытовала в разных регионах страны, хотя и оставалась редкой.