Фамилия Латифходжаев — одна из тех, что не вписывается в привычную русскую модель «Иван — Иванов». Она пришла из мусульманского мира, точнее из среднеазиатского региона, где арабский язык веками служил языком религии, культуры и личных имён. Её основа — составное арабо-персидское имя Латифходжа, которое и стало родовым прозвищем.

Разберём имя по частям. Первая часть — Латиф (от арабского لطيف — «добрый», «мягкий», «нежный»). В исламской традиции аль-Латиф — один из эпитетов Аллаха, означающий «Постигающий сокровенное» или «Милостивый». В качестве личного имени Латиф распространён у многих народов, исповедующих ислам. Вторая часть — Ходжа (от персидского خواجه — «господин», «хозяин», «наставник»). В Средней Азии ходжами называли потомков пророка Мухаммеда (через его дочь Фатиму и халифа Али) либо просто уважаемых людей, купцов, учителей. Таким образом, Латифходжа — это «добрый (или милостивый) господин», «почтенный Латиф».

Фамилия образована по русской модели с суффиксом -ев, который присоединяется к основам на мягкий согласный или гласный. В данном случае он добавлен к имени Латифходжа. В среде, где формировались такие фамилии (обычно среди узбеков, таджиков, частично уйгуров), окончание -ев указывало на принадлежность: «сын Латифходжи» или «из рода Латифходжи». В советское время, при массовой паспортизации, подобные именования закрепились официально.

Географически фамилия Латифходжаев наиболее характерна для Узбекистана, особенно для Ташкента, Ферганской долины и Самарканда. Встречается она и в Таджикистане, где имя Ходжа также имеет глубокие корни. В России носители этой фамилии — в основном потомки мигрантов из Средней Азии.

Интересно, что фамилия сохранила архаичную двухкорневую структуру, типичную для мусульманских имён XIX — начала XX века. В то время было принято давать ребёнку составное имя, где первая часть — благопожелание или атрибут Бога, а вторая — указание на социальный статус или религиозный авторитет. Со временем такие конструкции стали фамилиями, застыв в той форме, в какой их застала паспортизация.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Латифходжаев стоит в одном ряду с Латифовым (от просто имени Латиф) и Ходжаевым (от имени Ходжа). Но именно соединение двух корней делает фамилию более конкретной: она указывает не просто на обладателя имени, а на человека, чей предок носил двойное имя с чёткой социальной окраской — «почтенный наставник Латиф».