Фамилия Лепушенко — характерный пример украинской фамилии, образованной по продуктивной модели с суффиксом -енко. В украинской ономастике этот суффикс исторически означал «сын» или «потомок», то есть Лепушенко — буквально «сын Лепуша» или «маленький Лепуш». Такая модель была особенно распространена в Поднепровье и на Левобережной Украине в XVI–XVIII веках, и именно оттуда фамилия разошлась по другим регионам.

Основа фамилии — прозвище Лепуш. Его происхождение неочевидно, и здесь есть несколько версий. Самая вероятная связывает его с диалектным словом «лепуха» или «лепушка» — так в южнорусских и украинских говорах называли лепёшку, хлебец, а иногда и что-то мягкое, пухлое. Прозвище Лепуш могли дать человеку круглолицему, полному или просто любителю выпечки. В словаре украинских прозвищ встречаются похожие формы: Лепіх, Лепішка. Менее вероятна, но возможна связь с глаголом «лепить» — в значении «делать, мастерить», что могло указывать на гончара или строителя.

Второй вариант — отчество от имени Леп, которое могло быть сокращением от крестильного имени Филипп (в народной форме Леп). Тогда Лепуш — уменьшительная форма, а Лепушенко — «внук Лепа». Эта версия слабее, так как имя Леп не было широко распространено, но полностью исключать её нельзя.

Фамилия Лепушенко почти не встречается в России, её основной ареал — центральные и восточные области Украины, особенно Черкасская, Полтавская и Киевская области. В XIX веке носители фамилии числились преимущественно среди крестьян и казаков, что типично для украинских фамилий на -енко. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.

Таким образом, Лепушенко — фамилия, которая скорее всего родилась из бытового прозвища, связанного с внешностью или едой, и указывает на украинские корни её первых носителей.