Фамилия Лифанчикова — женская форма фамилии Лифанчиков, и её происхождение напрямую связано с мужским прозвищем Лифанчик. В основе лежит имя Лифан, которое является просторечной, народной формой канонического крестильного имени Иулиан (от латинского Julianus — «принадлежащий Юлию»). В русском языке имя Иулиан в быту звучало как Ульян, Льян, Лиан, а затем — Лифан. Такая трансформация характерна для диалектов, где «л» и «ф» появлялись в результате перестановки звуков (метатезы) или упрощения труднопроизносимых сочетаний.

Суффикс -чик в основе Лифанчик указывает на то, что так могли называть молодого человека или сына Лифана — уменьшительная форма была распространённой в среде крестьян и посадских людей. Затем к прозвищу Лифанчик добавился притяжательный суффикс -ов, образовав фамилию Лифанчиков — «чей?» — «сын Лифанчика». Женский вариант Лифанчикова закрепился в официальных документах как форма для замужних женщин и вдов.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным регионам России, особенно к бывшим Вологодской, Архангельской и Костромской губерниям. Там формы на -их/-ых и -ов/-ев с уменьшительными суффиксами встречаются чаще, чем на юге. Встречается также вариант Лифончиков — с заменой «а» на «о», что характерно для акающих говоров.

В отличие от фамилий на -ин (Петров — Петрищев), модель Лифанчиков — редкая: она сохранила в основе не просто имя, а его уже переоформленную уменьшительную форму. Это делает фамилию своеобразным маркером диалектной истории имени Иулиан.