Фамилия Лифашин — одна из тех, где исходное имя почти исчезло из обихода, а фамилия осталась. Она образована от прозвищного или уменьшительного имени Лифаша. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Лифашин буквально значит «сын Лифаши» или «человек из рода Лифаши».

Само имя Лифаша — это не самостоятельное крестильное имя, а народная, бытовая форма. Чаще всего её связывают с одним из трёх канонических имён: Селиван (латинское Silvanus — «бог лесов»), Нифонт (греческое «рассудительный») или Вонифатий (латинское «творящий благо»). В русской традиции такие длинные и непривычные для слуха имена часто сокращали до двух-трёх слогов, добавляя мягкий суффикс -ша. Так на свет появлялись не только Лифаша, но и, например, Тимоша от Тимофей или Миша от Михаил.

Какой из трёх вариантов — Селиван, Нифонт или Вонифатий — стал основой для Лифаши, сказать наверняка сложно. Фонетически ближе всего стоит Селиван: если отбросить первый слог (Се-), остаётся Ливан, а форма Лифаша могла возникнуть через замену «в» на «ф» (явление, распространённое в народной речи) и добавление суффикса. Однако не менее вероятно, что Лифаша — это самостоятельное производное от Нифонта (Нифонт → Нифа → Лифаша с начальным «л» под влиянием аканья или простонародного произношения). Третий вариант, Вонифатий, давал бы скорее форму Ваня или Фаня, но и от него могла отпочковаться Лифаша через усечение и переосмысление.

В любом случае, фамилия Лифашин фиксирует прозвище, которое дали человеку в быту, а не его церковное имя. Это типичная модель для русских фамилий XVI–XVII веков, когда крестьяне и посадские люди получали фамилии по имени отца или деда, часто в уменьшительной форме. Географически фамилия редкая, встречается преимущественно в центральных и южных областях России, что косвенно подтверждает её происхождение из среды, где церковные имена перерабатывались местными говорами.

Таким образом, носитель фамилии Лифашин может считать своим предком человека, которого в деревне или слободе звали Лифаша — скорее всего, Селивана, Нифонта или, реже, Вонифатия, чьё полное имя сократили и приспособили к повседневному языку.