Фамилия Лигеева — женская форма, мужской вариант — Лигеев. В центре внимания здесь не столько основа, сколько суффикс: -еев. В русских фамилиях он встречается реже, чем привычные -ов/-ев, и указывает на происхождение от прозвища или имени, оканчивающегося на -ей. То есть предка могли звать Лигей — скорее всего, так звучало уличное прозвище, а не крестильное имя.

Корень «Лиг-» тёмный. В русских говорах слово «лига» или «лигой» называли что-то вязкое, топкое, болотистое, а также лукавого, хитрого человека. В некоторых диалектах «лига» — это жижа, грязь, трясина. Отсюда прозвище Лигей могли дать человеку, который жил у болота, работал в грязи (например, гончар или землекоп) или, наоборот, отличался уклончивым, скользким характером. Вторая версия — тюркская: в татарском и башкирском языках есть имя Лигей (Лигәй), восходящее к слову со значением «достойный», «почётный». В этом случае фамилия могла возникнуть в среде крещёных татар или башкир, переселившихся в русские губернии.

География фамилии подсказывает, что жива она в Поволжье и Приуралье — в Самарской, Оренбургской областях, в Татарстане и Башкортостане. Это как раз зона контакта русских и тюркских диалектов. Если предки Лигеевых были из Самарской губернии, тюркская версия выглядит правдоподобнее: там фамилии на -еев часто давали крещёным татарам. Если же фамилия встречается в северных или центральных русских областях, скорее сработало прозвище от диалектного «лига».

В документах XVIII–XIX веков фамилия не засветилась в дворянских родословных — значит, предки были крестьянами, мещанами или однодворцами. Никаких громких исторических личностей с такой фамилией не известно, что не редкость: многие фамилии жили в одной-двух деревнях и не выходили за пределы волости.