Фамилия Лиготина — редкий случай, когда неочевидная основа скрывает за собой, скорее всего, не имя, а прозвище или диалектное слово. В её основе лежит корень «лиг-», который в русских говорах имел несколько значений, и разобраться в них — главная задача этимолога.

Самый вероятный источник — диалектный глагол «лиготать» или существительное «лигота». В северных и сибирских говорах «лиготать» означало «шататься без дела», «баклушничать», а «лигот» — это бездельник, лодырь. Соответственно, Лигота — прозвище нерадивого, праздного человека. Такие прозвища по характеру или поведению были в ходу у крестьян: они давались не в обиду, а как меткая бытовая характеристика, которая потом закреплялась в фамилии.

Менее распространённая, но возможная версия связывает фамилию с южнославянскими корнями, где «лига» или «лиго» может означать «луг», «низина». Однако для русской фамилии это маловероятно: суффикс -ин указывает на принадлежность конкретному лицу («чей?» — сын Лиготы), а не на местность. География фамилии подтверждает её русское происхождение: Лиготины встречаются в Тверской, Псковской и Вологодской областях — именно в тех регионах, где фиксировался глагол «лиготать».

Фамилия образована по архаичной модели: от прозвища на -а (Лигота) с помощью притяжательного суффикса -ин. Такая модель типична для северных и центральных русских земель. Важная деталь: ударение в фамилии, скорее всего, падает на второй слог — Лиго́тина, что тоже сближает её с глагольной основой (лигота́ть). Если бы ударным был первый слог (Ли́готина), это могло бы указывать на иноязычное происхождение, но такой вариант в документах не зафиксирован.

Таким образом, предок носителей фамилии Лиготина — не ремесленник и не крестьянин с определённым занятием, а человек, получивший прозвище за свой неторопливый или праздный нрав. В этом смысле фамилия стоит в одном ряду с такими, как Лентяев, Гуляев или Бездельников, но звучит гораздо реже и сохранила диалектный колорит.