Фамилия Лихалатов — редкая и структурно необычная. В ней сразу заметна двойная основа: первая часть «лиха-» и вторая «-лат-». Такие сложные фамилии часто возникали в среде, где прозвище человека складывалось из двух значимых слов, а потом закреплялось в официальной записи.

Разберем первую часть. «Лихой» в древнерусском языке имело два основных значения: «удалой, смелый, бойкий» и, наоборот, «злой, тяжёлый, причиняющий беду». Прозвище Лихой или Лихой давали либо отчаянному смельчаку, либо человеку с тяжёлым характером. В прозвищах это слово встречалось часто: Лихов, Лихачев, Лихолетов.

Вторая часть «-лат-» — самая загадочная. Она может восходить к греческому «латос» (камень, скала) или к латинскому корню, но в русской народной среде такое объяснение маловероятно. Куда правдоподобнее, что «лат» — это искажённое или сокращённое от «латыш» или «латынь» (в значении «латинянин», то есть католик). В говорах «латышом» могли называть любого прибалта или даже человека, говорящего на непонятном языке. Тогда Лихалатов — потомок человека, которого прозвали Лихой Латыш, то есть «смелый (или злой) прибалт». Подобные прозвища возникали на северо-западе России, в землях, граничивших с Ливонией, Псковщиной и Новгородчиной.

Суффикс «-ов» указывает на стандартную русскую модель образования фамилий: «чей?» — Лихалатов, то есть сын Лихалата. Такой суффикс закрепился за фамилиями в центральных и северных губерниях, что подтверждает привязку к северо-западу.

Встречается версия, что фамилия происходит от тюркского «лихалат» (некое звание или титул), но она не подкреплена ни словарными данными, ни историческими документами. Тюркские корни в этой фамилии не прослеживаются, а окончание «-ов» при тюркской основе было бы редким для XVI–XVII веков.

Таким образом, наиболее вероятное объяснение: Лихалатов — это русифицированная фамилия от прозвища Лихой Латыш, закрепившаяся в приграничных с Прибалтикой землях. Предок носителя был либо смелым человеком не местного происхождения, либо человеком с непростым нравом, которого так прозвали соседи.