Основой фамилии Ликсютин послужило имя Ликсюта. Имя Ликсюта, вероятно, является уменьшительно-ласкательной формой одного из следующих крестильных имен: Алексей (в переводе с греческого - «заступник, помощник»), Александр («защитник», «мужественный») или Феликс (от латинского felix – «счастливый»). Таким образом, потомок человека, обладающего именем Ликсюта, со временем получил фамилию Ликсютин.