Фамилия Лиленков — редкий случай, когда основа не очевидна на первый взгляд. Здесь не разглядеть сразу профессию или черту характера, как в Кузнецове или Добронравове. В её основе лежит либо уменьшительная форма личного имени, либо прозвище, и обе версии имеют право на существование.

Самый прямой путь — от разговорной формы крестильного имени. В православных святцах есть имя Ли́верий (от латинского «свободный»), которое в народе переделывали в Ли́верий, а затем и в Ли́ля. Уменьшительное Лиля, Лилян, Лиленок дало фамилию Лиленков. Модель образования простая: суффикс -енок в русских фамилиях указывает на «сына» или «младшего» (ср. Козленков, Теленков), а затем добавился патронимический суффикс -ов. То есть Лиленков — буквально «сын Лиленка», а Лиленок — «маленький Лиля». Эта версия предпочтительна, потому что опирается на реальное имя, известное в дореволюционной России, хоть и не самое частое.

Вторая версия — от прозвища Ли́ля, Ли́ленок. В южнорусских и украинских говорах «лиля» или «ліля» могло означать нечто нежное, хрупкое, даже куклу или игрушку. В таком случае прозвище давали субтильному, изящному человеку, либо, наоборот, — с иронией, крупному и неуклюжему. В пользу прозвищного происхождения говорит то, что фамилия довольно редкая и географически привязана к центральным и южным областям России, где такие диалектные слова бытовали.

Интересная деталь: фамилия Лиленков могла возникнуть и на стыке двух языковых традиций. В белорусском и украинском языках суффикс -енко (-енок) образует фамилии не только от имён, но и от названий животных или птиц. Если бы основа была «лил» — вряд ли. Но «лиля» как имя или прозвище — это как раз тот случай, когда фамилия могла «переехать» вместе с носителем из Малороссии в великорусские губернии, где суффикс -енок переоформили под местное произношение в Лиленков.

Написание фамилии устойчивое, с буквой «е» в корне. Вариант «Лилинков» встречается, но крайне редко и, скорее всего, является результатом ошибки в документах. В любом случае, предок носителя этой фамилии был человеком, которого в семье или на деревне называли ласково — Лиля или Лиленок, и это прозвище закрепилось за его потомками.