Фамилия Лилитка — редкая и нестандартная для русского уха. Первое, что бросается в глаза: в ней нет типичных фамильных суффиксов вроде -ов, -ин или -ский. Это указывает на то, что перед нами не патроним (не «чей-то сын»), а застывшее прозвище или, что вероятнее, усечённая форма от более длинной фамилии.

Самый прямой путь к объяснению — украинское или белорусское происхождение. В этих языках фамилии на -ко (Лилитко) встречаются сплошь и рядом. Если убрать конечное -а, получится «Лилитко» — типичная модель для Западной Украины или юга Беларуси. Такие фамилии часто образовывались от имён или прозвищ с уменьшительно-ласкательным оттенком. Основа «Лилит» здесь сбивает с толку: в русском языке это имя демоницы из еврейской мифологии (первой жены Адама). Но в крестьянской среде XIX века такое имя дать ребёнку не могли — слишком книжное и нехристианское. Значит, корень иной.

Вероятнее всего, основа — диалектное или просторечное слово «лилитка» (или «лилит»), означавшее что-то маленькое, нежное, возможно, производное от «лилия» или «лелеять». В украинском языке есть глагол «леліяти» — лелеять, холить. Отсюда могло возникнуть прозвище «Лілітка» для ласкового, изнеженного человека или, напротив, для того, кто занимался выращиванием цветов (лилий). Суффикс -к- в украинских фамилиях часто придаёт уменьшительность: Лилитка — «маленькая Лилия» или «Лилечка».

Есть и вторая версия, более прозаичная: фамилия могла возникнуть как искажённое «Лилитко» при переписи населения. Писарь мог записать украинскую фамилию на слух, а потом, при переходе в русский паспорт, окончание -о заменили на -а по аналогии с русскими фамилиями женского рода. В результате «Лилитко» превратилось в «Лилитка», и форма закрепилась.

Географически фамилия тяготеет к западнорусским и украинским регионам. Встречается она редко, что говорит о локальном происхождении — возможно, от одного родоначальника в конкретном селе. Сословно носители могли быть крестьянами или мещанами, поскольку дворянские фамилии редко обходились без суффикса -ов/-ев.

Таким образом, Лилитка — скорее всего, украинская или белорусская фамилия, образованная от ласкового прозвища, связанного с цветком лилией или глаголом «лелеять». Её необычное звучание — результат языковой обработки на стыке культур, а не мистического подтекста.