Фамилия Липезины образована по распространённой модели от основы «липез(а)» с помощью патронимического суффикса -ин, указывающего на принадлежность к предку. Суффикс -ин в русской ономастике закреплялся за основами на -а/-я, поэтому фамилия Липезин буквально означает «сын или потомок Липезы». В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще образовывались от мужских имён и прозвищ с твёрдой основой, модель с -ин типична именно для прозвищ и имён, оканчивающихся на гласный.

Само прозвище Липеза, скорее всего, связано с диалектным словом «липеза» — так в некоторых южнорусских и украинских говорах называли льстеца, подлизу, человека, который умело добивается расположения. В словаре В. И. Даля «липеза» — это «ласкатель, льстец, подлиза». Прозвища такого рода давались не столько с осуждением, сколько с ироничным наблюдением за характером или поведением человека. Реже основой могло стать искажённое личное имя, например, от греческого Филипп (через уменьшительные формы вроде Липа, Липка), но для формы Липеза это менее вероятно: суффикс -ез- в русских прозвищах встречается редко и обычно несёт экспрессивный оттенок.

Фамилия Липезины — не единственная в своём ряду. В ономастике восточных славян встречаются однокоренные фамилии Липезин, Липезный, Липезников, а также более распространённые Липкин, Липов, Липатов. Все они восходят к разным основам, но общий корень «лип-» (от «липнуть», «льнуть») прослеживается в значении «прилипала», «льстец». Это делает фамилию Липезин частью группы прозвищных фамилий, описывающих человеческие качества, а не географию или ремесло.

Судя по модели и редкой основе, фамилия Липезин могла закрепиться в среде крестьян или посадских людей, где прозвища передавались по наследству без изменения. В дворянских родословных эта фамилия не встречается, что косвенно указывает на её простонародное происхождение. Точное место возникновения установить сложно: фамилия фиксируется в южнорусских областях, а также в Белоруссии и на Украине, где диалектное слово «липеза» было в ходу. Окончательно говорить о времени и месте происхождения фамилии Липезин можно лишь после серьёзных генеалогических изысканий, но её прозвищная основа и словообразовательная модель позволяют уверенно отнести её к пласту древних русских фамилий, возникших не позднее XVII века.