Фамилия Липнякова — женская форма фамилии Липняков, и её происхождение стоит искать в мужском варианте. Основа фамилии — «липняк», слово с прозрачной этимологией: липняком на Руси называли липовый лес, рощу. Человек, живший у такого леса или в нём, мог получить прозвище Липняк. В говорах слово «липняк» имело и переносное значение — так иногда называли простоватого, доверчивого человека, намекая на мягкость липовой древесины. Но первая версия, топографическая, надёжнее: фамилии, образованные от названий местности, в русской ономастике встречаются часто.

Суффикс -ов- в фамилии Липняков указывает на типичную модель русских фамилий, возникших как притяжательные прилагательные: «чей?» — Липняков, то есть сын или потомок Липняка. Это одна из самых распространённых моделей в центральной и северной России. Фамилия не относится к редким суффиксальным типам (вроде -их, -ских), и её география, скорее всего, связана с лесными регионами средней полосы, где липа — обычное дерево: Владимирская, Нижегородская, Костромская, Рязанская области.

Стоит обратить внимание на однокоренные фамилии: Липкин, Липов, Липский. Липняков выделяется именно основой «липняк» — это не просто дерево, а лесной массив, что даёт более конкретную привязку к месту жительства. В документах XVII–XVIII веков прозвище Липняк встречается среди крестьян и однодворцев — людей, чья жизнь была тесно связана с лесом: бортников, смолокуров, углежогов. Если предки Липняковых занимались промыслами, то липовый лес давал сырьё для лыка, мочала и деревянной утвари.

Фамилия не аристократическая, не дворянская — в старых родословных книгах она не значится. Но это не умаляет её ценности как маркера быта и ландшафта: за ней стоит конкретный человек, живший в определённом месте, имя которому дала природа.