Скорее всего, в основе фамилии Липнягова лежит прозвище Липняга, которое восходит к украинскому слову «липник», то есть лепщик, гончар. Таким образом, возможно, что основатель рода Липняговых бы гончаром по профессии. Менее вероятно, что эта фамилия происходит от мирского имени Липень, что в белорусском языке означает «июль». Возможно, это имя дали ребёнку, родившемуся в июле. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Липняга, со временем получил фамилию Липнягова.