Фамилия Липная — редкий случай, когда в основе лежит не мужское имя или прозвище, а женское прилагательное. В русской ономастике это сразу указывает на особую модель образования: фамилия застыла в форме женского рода. Чаще всего так закрепляли прозвище за женщиной или называли её по месту жительства, реже — по роду занятий, если ремесло считалось женским.

Корень «лип-» отсылает к липе — дереву, широко распространённому в средней полосе. Прилагательное «липная» в говорах могло означать «сделанная из липы» или «относящаяся к липе». Отсюда первая и самая вероятная версия: прозвище Липная давали женщине, которая жила у липовой рощи, либо происходила из села с названием Липное, Липня или Липовка. Таких топонимов десятки по всей России, Украине и Белоруссии, и фамилия могла закрепиться за переселенцами, переехавшими в другую местность.

Вторая версия связана с ремеслом. Липовое дерево — мягкий и податливый материал, из него делали ложки, посуду, игрушки. Женщину, которая занималась резьбой по липе или плетением из лыка (луба), могли прозвать Липной. В крестьянском быту это было обычным делом: заготовка лыка на лапти, изготовление лубяных коробов и туесов — промысел, в котором участвовали и женщины.

Фамилия Липная не имеет суффикса принадлежности (-ов, -ев, -ин), который обычно указывает на отчество. Это так называемая «окаменевшая» форма прилагательного, характерная для южнорусских и украинских регионов. Встречается она в основном на территории современной Украины, в Белгородской и Воронежской областях России. В официальных документах XIX века такую фамилию могли записать за женщиной, а мужчина в той же семье носил бы форму Липной или Липный.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Липов, Липкин, Липский — показывает разницу: Липов и Липкин образованы от мужских прозвищ (Липок, Липа), а Липная сохранила женский род исходного прозвища. Такая модель встречается редко и говорит о том, что фамилия могла закрепиться именно за женщиной-вдовой или за матерью, чьи дети получили прозвание по ней, а не по отцу.