Фамилия Лищенецкая — редкий пример, в котором славянская основа сплелась с польским или западнорусским оформлением. Её сразу выделяет окончание «-цкая»: это типичный суффикс польских и украинско-белорусских дворянских фамилий, образованных от названий мест. В старом польском языке форма «-ецкий»/«-цкий» означала «из такого-то места» или «владеющий таким-то имением». То есть Лищенецкая — это вариант фамилии Лищенецкий, приспособленный для женщины, но в основе лежит мужской вариант.

Корень фамилии — «Лищен-» или «Лищ-». Тут возможны два объяснения, и оба ведут в географию. Первое: от названия населённого пункта — например, деревни Лищенец или Лищанец. Такие топонимы встречаются на территории бывшей Речи Посполитой (современные Польша, Беларусь, Западная Украина). В основе может лежать слово «лища» — диалектное название лысины, прогалины в лесу или, по другой версии, зарослей орешника. Второе: от личного прозвища Лищень (с уменьшительным суффиксом -ень). Прозвище могли дать человеку с лысиной («лища» — плешь) или, реже, тому, кто жил у «лищи» — заросшего оврага.

Суффикс «-ец-» в середине слова (Лищ-ен-ец-кая) указывает на то, что фамилия образована не напрямую от прозвища, а от названия жителя определённой местности: «лищенец» — человек из Лищени/Лищанца. Это типичная модель для фамилий на «-ский»: к названию места прибавляли суффикс принадлежности, и получалось «Лищенецкий». Такие фамилии в XVII–XIX веках часто закреплялись за шляхтой, но не только: их могли получить и крестьяне после отмены крепостного права, если их записывали по месту рождения.

Встречаемость фамилии сегодня крайне низкая. Она почти не фиксируется в современных российских телефонных справочниках, что говорит о её узколокальном происхождении: скорее всего, предки Лищенецких жили в одном из сёл на границе современной Украины и Беларуси или в восточных воеводствах Польши. Написание через «щ» (а не через «шч») — это уже русская или украинская адаптация польского звучания. В польском оригинале фамилия могла бы выглядеть как Liszczeniecka или Liszczenecka, но в восточнославянской передаче «szcz» превратилось в «щ».

Если сравнивать с однокоренными, то ближайшая параллель — фамилия Лищенко, распространённая на Украине. Но Лищенецкая стоит особняком: она не «сыновья» (суффикс -енко), а «географическая» (суффикс -ский). Это значит, что её носительница или её предки-мужчины, скорее всего, происходили из одного конкретного хутора или деревни, название которой со временем стёрлось с карт.