Фамилия Лишунина — редкий пример, когда женская форма прочно закрепилась в документах, хотя по правилам русского языка исходной считается мужская — Лишунин. По сути, это «мать» или «жена Лишунина», но в современных реалиях фамилия воспринимается как равноправная, и носительницы чаще всего не задумываются о её родовой истории.

Разбираем словообразование. Основа — «Лишун». Это не имя и не географическое название, а скорее всего прозвище. В русских говорах «лиша» или «лишун» могло означать человека, который остался лишним, например, лишний в семье ребёнок или тот, кто не вписался в общину. Другая, более бытовая версия: «лишун» — тот, кто любит прихвастнуть лишнего, приврать или сделать что-то сверх меры. Суффикс «-ун» типичен для прозвищ по действию или качеству (говорун, крикун, бегун). Значит, Лишунин — потомок человека по прозвищу Лишун.

Модель фамилии — «-ин». Это самый распространённый суффикс для фамилий, образованных от основ на -а, -я. Фактически это притяжательное прилагательное: «чей сын?» — Лишунин, то есть сын Лишуна. Такая модель была характерна для северных и центральных регионов России, но в случае с Лишуниными географию сузить сложно: фамилия редкая, встречается разрозненно, без ярко выраженного гнезда.

Интересно, что фамилия могла возникнуть и от канонического имени Елисей через его уменьшительную форму «Лиша» или «Лишун». В народной речи имя Елисей нередко сокращали до Лисея, а потом до Лиши. Если так, то Лишунин — это «внук Елисея», и прозвищный подтекст здесь отсутствует. Обе версии имеют право на жизнь, но прозвищная выглядит убедительнее: в русской ономастике прозвища с корнем «лиш-» фиксируются чаще, чем вторичные формы от имён.

Никаких громких исторических личностей с этой фамилией не известно, и это нормально для фамилии, которая не принадлежала дворянству или купечеству первой гильдии. Скорее всего, предки носителей Лишуниной были крестьянами или мещанами, а сама фамилия закрепилась в каком-то одном селе или уезде, откуда и пошла по родственным связям.