Фамилия Лизенков образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Лизенков послужило церковное имя Елизар. Фамилия Лизенков, вероятно, ведет свое начало от имени Лиза, которое представляет собой просторечную форму мужского имени Елизар. В переводе с древнееврейского оно означает "Бог помог". По другой версии, данная фамилия образована от прозвища Лиза, которое, вероятно, происходит от нарицательного «лизун». Скорее всего, фамилия Лизенков изначально возникла на территории Украины или Белоруссии, о чем свидетельствует характерный суффикс -енко. Со временем, вероятно, род Лизенко переехал в Россию, где и произошла русификация фамилии путем добавления суффикса -ов. О точном месте и времени возникновения фамилии Лизенков в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Лизенков представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.