Фамилия Лизенковы — один из примеров того, как украинская или белорусская фамилия обрела русскую форму. В основе лежит имя Лиза, но не женское, а просторечная форма мужского церковного имени Елизар. В переводе с древнееврейского Елизар означает «Бог помог». Такое сокращение имен на Руси было обычным делом: полное имя в быту уживалось рядом с коротким, которое и закреплялось за потомками.

Первоначальная форма фамилии — Лизенко. Суффикс -енко характерен для Украины и Белоруссии, где он указывал на происхождение: сын Лизы. Когда носители фамилии переселились в великорусские земли, фамилию адаптировали к местной модели, добавив типичный русский суффикс -ов. Так Лизенко превратился в Лизенкова.

Есть и другая версия: фамилия могла пойти не от имени, а от прозвища Лиза. В таком случае его связывают с нарицательным «лизун» — так могли назвать льстивого, угодливого человека или же любителя сладкого. Обе гипотезы имеют право на существование, но первая — от имени Елизар — выглядит надёжнее, поскольку прозвище Лиза встречается реже, чем сокращённая форма имени.

О точном времени появления фамилии говорить сложно: процесс становления фамилий у восточных славян растянулся на несколько столетий. Ясно одно: Лизенковы — не случайный набор звуков, а отражение давних миграций и языковых контактов между русскими, украинцами и белорусами.