Фамилия Ломтин — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти наверняка не связано с ломом как инструментом. Основа «Ломт-» здесь, скорее всего, от глагола «ломать» или существительного «ломоть» (кусок, отломленная часть). Человек мог получить прозвище Ломоть за крепкое телосложение («ломоть здоровый») или за манеру есть большими кусками. Вторая версия — прозвище Ломота, данное тому, кто часто жаловался на ломоту в костях или сам страдал от неё.

Суффикс «-ин» указывает на принадлежность: Ломтин — «сын Ломти» или, что вероятнее, «сын Ломтя». В русской ономастике фамилии на -ин образовывались от основ на -а/-я, поэтому исходное прозвище должно было звучать как Ломтя или Ломоть. Форма Ломтин закрепилась в результате стяжения: Ломоть → Ломтя → Ломтин. Фамилия не дворянская и не семинарская — она из разряда «простых», крестьянских или посадских, что подтверждается её бытованием в северных и центральных губерниях (Архангельская, Вологодская, Костромская области), где говор «окающий» и сохраняет старую основу.

Интересная деталь: фамилия Ломтин могла возникнуть и из топонима — деревни Ломтино или Ломтево, которых немало на Русском Севере. В таком случае предок был не прозван, а назван по месту жительства: «из Ломтина» → Ломтин. Обе версии рабочие, но прозвищная — более вероятна: слишком конкретна основа, чтобы быть просто географической привязкой. Сравните с однокоренными фамилиями: Ломтев (с типичным для юга суффиксом -ев) и Ломов — там корень уже «лом» как инструмент. Ломтин стоит особняком, сохраняя память о бытовом прозвище или физической особенности первого носителя.