Фамилия Лошагин — один из тех случаев, где внешняя прозрачность обманчива. Кажется, что корень «лошак» (помесь осла и лошади) или «лошадь» лежит на поверхности, но словообразовательная модель подсказывает иной путь.

Фамилия образована с помощью патронимического суффикса -ин, который в русской традиции чаще всего присоединялся к основам, оканчивающимся на -а или -я. Соответственно, исходное имя или прозвище звучало как Лошага. Вопрос в том, что оно означало. Самая вероятная версия — это прозвище от глагола «лошить» (в некоторых говорах — «лгать», «обманывать», «хвастать»). Человека, который любил приврать или прихвастнуть, могли прозвать Лошагой. Эта версия подтверждается тем, что в старых документах встречаются фамилии Лошаков, Лошагин, и их носители не обязательно имели отношение к конюшне.

Менее вероятная, но не исключённая версия — связь с диалектным словом «лошага» в значении «жеребёнок» или «небольшая лошадка». В таком случае прозвище могло относиться к человеку маленького роста, суетливому или, наоборот, работящему, как лошадь. Однако в этом случае ожидалась бы форма Лошагин от Лошага, а не от «лошадь» (было бы Лошадин или Лошадкин).

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным регионам России, особенно к Вологодской и Архангельской губерниям, где был активен суффикс -ага (ср. Шубин — Шубагин, Кулагин). Встречается она нечасто, что говорит о её локальном происхождении: вероятно, в одной-двух волостях жил крестьянин или ремесленник с прозвищем Лошага, и его дети пошли по фамилии Лошагины.

Таким образом, предок современных Лошагиных, скорее всего, не был конюхом или торговцем лошадьми. Он был человеком с характером — возможно, говорливым и не всегда правдивым, за что и получил своё прозвище.