Фамилия Лубашкина — женская форма, исходно мужская — Лубашкин. Она образована по продуктивной русской модели с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — сын Лубашки, дочь Лубашкина. Основа здесь — прозвище или неканоническое имя Лубашка.

Самый вероятный корень — глагол «лубить», который в русских говорах означал «лущить, сдирать кору, обдирать». В словаре Даля «лубить» — это, в частности, сдирать луб (кору липы, идущую на мочало или лыко). Лубашкой могли прозвать человека, занятого таким ремеслом: лудильщика коры, заготовщика лыка или мастера, который делал из луба кузова, короба и другую домашнюю утварь. Промысел был распространён в лесных районах северной и центральной России, особенно в Вологодской, Костромской, Архангельской губерниях.

Есть и другая, менее очевидная версия — от диалектного «луба́шка» как названия особой мужской рубахи (ср. «луб» — грубая ткань?). Но она слабее: слово «лубашка» в значении одежды фиксируется редко и локально, тогда как прозвища по ремеслу — типичный источник фамилий.

Встречается ли фамилия в дворянских родословных? Скорее всего, нет: суффикс -ин и прозвищная основа без книжного корня выдают крестьянское или мещанское происхождение. Лубашкины — это люди, чей предок был мастеровым, добывавшим луб, или просто получил прозвище по характерному занятию.

В написании фамилии примечательна буква «ш» в суффиксе: она нередко появляется в уменьшительных формах имён и прозвищ (ср. Лука — Лукашка, Лубянка — Лубашка). Это говорит о том, что перед нами не просто профессиональная кличка, а ласкательное или обиходное прозвище, которое закрепилось за родом.