Фамилия Лубышев образована от личного прозвища Лубыш. В его основе лежит слово «луб» — так называли внутреннюю, волокнистую часть коры липы, а также саму липовую кору, из которой крестьяне делали мочало, рогожи, кузова, короба и знаменитые лукошки. Прозвище Лубыш могли дать либо торговцу такими изделиями, либо мастеру-лубочнику, который драл луб и плёл из него нехитрую домашнюю утварь. В русских говорах слово «луб» имело и переносное значение — «твёрдая, грубая кожа», поэтому не исключено, что прозвище иногда закреплялось за человеком с жёстким, несгибаемым характером, но это уже область предположений.

По словообразовательной модели фамилия Лубышев типична для восточнославянского ономастикона: суффикс -ев присоединяется к основе, оканчивающейся на шипящий (Лубыш → Лубышев). Такая модель указывает на принадлежность потомка конкретному лицу — «сын Лубыша». Встречается и вариант написания с буквой «о» (Лубышов), но он менее распространён и часто возникает из-за местных особенностей произношения или ошибок писцов.

О точном месте и времени возникновения фамилии говорить сложно: процесс становления русских фамилий был долгим и занял несколько столетий. Однако можно предположить, что прозвище Лубыш бытовало в северных и центральных губерниях России, где липовые леса были основным источником сырья для крестьянских промыслов. Лубяное производство — одно из древнейших на Руси, и фамилия Лубышев, вероятно, ведёт начало из среды ремесленников или мелких торговцев, а не из дворянского сословия.

В отличие от многих «профессиональных» фамилий (Кузнецов, Мельников), Лубышев сохранила связь с конкретным материалом и технологией, что делает её ценным свидетельством народного быта. Это не просто фамилия, а отражение целого пласта материальной культуры — от заготовки лыка до плетения корзин.