Фамилия Лукеник — редкая и структурно прозрачная, что позволяет уверенно говорить о её происхождении, даже не имея массовых статистических данных. Её основа — имя или прозвище Лука, которое восходит к латинскому lux, lucis («свет»). В русской и украинской среде это имя было одним из самых распространённых, часто встречалось в форме Лука, а уменьшительные варианты — Луканя, Лукаш, Луконя.

Ключевая особенность фамилии — суффикс -ик. В восточнославянской ономастике он обычно указывает на «сына» или «потомка»: Лукеник буквально означает «сын Лукени» (то есть потомок человека по прозвищу Лукеня). Сама форма Лукеня — это просторечная, уменьшительно-ласкательная производная от Лука, аналогичная парам Иван — Иваненя, Петр — Петреня. Такая модель образования (основа на -еня + суффикс -ик) характерна для западных регионов — Беларуси, западной Украины, а также для польского влияния, где суффикс -ik (или -czyk) был продуктивным.

Географически фамилия Лукеник сегодня встречается в основном среди носителей из Беларуси и западных областей Украины, реже — в России. В белорусских и украинских говорах слово «лукеня» могло быть не только именем, но и прозвищем для человека с каким-то заметным качеством (например, светлого, «лучистого» нрава), но это вторично. Первично всё же личное имя.

Сословно Лукеники, скорее всего, относились к крестьянству или мещанству — фамилии с таким суффиксом редко встречались у дворянства, которое предпочитало модели на -ов/-ев или польские на -ский. В документах XIX века можно найти упоминания Лукеников в метрических книгах Минской и Гродненской губерний, что подтверждает западнорусский ареал.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Лукьянов, Лукашевич, Лукин — показывает, что Лукеник стоит особняком: у него нет патронимического суффикса -ов или -евич, а есть редкая уменьшительная основа с «вторичным» суффиксом. Это делает фамилию не просто указанием на отца, а на конкретного предка по прозвищу Лукеня, что добавляет ей индивидуальности.