Фамилия Лухта — редкий случай, когда прозвище или имя перешло в фамилию почти без изменений, без суффиксов -ов, -ин или -ский. Такая «голая» форма (Лухта, а не Лухтин) характерна для украинской, белорусской и южнорусской традиции, а также для фамилий, которые закрепились поздно, уже в XIX веке, когда патронимические суффиксы могли опускаться.

Корень «лухт-» — тёмный и спорный, что делает фамилию особенно интересной для этимолога. Самая вероятная версия связывает её с диалектным словом «лухта» или «лухтать». В северных и сибирских говорах «лухтать» означало «шататься без дела», «слоняться», а «лухта» — нерадивого человека, ротозея или лентяя. Прозвище могли дать человеку медлительному или рассеянному. В этом случае фамилия — из разряда «характерологических», как Лентяев или Гуляев, но с более узкой локальной привязкой.

Менее распространённая, но возможная версия — от финно-угорского субстрата на Русском Севере. Слово «лухта» в карельских и вепсских говорах могло означать что-то связанное с водой, заливом или лугом (сравните с топонимом Лухта — название реки и деревни в Архангельской области). Если предок жил у реки Лухты, его могли прозвать по месту жительства, и это прозвище стало фамилией. В пользу этой гипотезы говорит география: носители фамилии Лухта чаще всего встречаются именно на севере европейской части России и в Сибири, куда переселялись северяне.

Есть и третья версия, более экзотическая: от немецкого или голландского Luft (воздух) или голландского lucht (лёгкий). Но она маловероятна для крестьянской среды: фамилии из западноевропейских корней обычно появлялись у обрусевших немцев или через семинарию, а Лухта не похожа на искусственную семинарскую фамилию.

Таким образом, с высокой долей вероятности предок носителя фамилии Лухта — либо нерасторопный человек из северной деревни, либо выходец с берегов одноимённой речки или ручья. Сословно фамилия, скорее всего, крестьянская или мещанская, без дворянского следа.