Фамилия Лухтина образована от прозвища Лухта. В основе, скорее всего, лежит белорусское слово «лухта» — шелуха. Такое прозвище могло относиться к профессиональным именованиям: предок современного носителя фамилии мог заниматься очисткой гречи или другой крупы от шелухи, то есть был крупорушником. Модель образования проста и типична для русских фамилий: суффикс -ин указывает на принадлежность, означая «сын Лухты» или «человек из семьи Лухты».

Есть и другая версия, менее распространённая, но лингвистически возможная. Прозвище Лухта могло вести начало от эстонского luht — «луг». В этом случае прозвище давали по месту жительства: человек, живший у большого луга или на пойменных землях. Эстонский след не случаен: фамилия встречается в регионах, граничащих с Прибалтикой, например в Псковской области, где исторически были контакты с чудскими племенами.

Примечательно, что в фамилии сохранился редкий для русской ономастики корень. Однокоренных фамилий (Лухтин, Лухтанов, Лухтаев) мало, и все они сконцентрированы на северо-западе России. Это указывает на локальное бытование прозвища, не ушедшего далеко от места своего возникновения.

В отличие от распространённых фамилий на -ов/-ев, форма на -ин (Лухтина) в женском роде не меняется при склонении, что создаёт путаницу в документах: носительница фамилии может быть записана как Лухтина, а её отец — как Лухтин. В быту же фамилия прочно закрепилась в женской форме, что говорит о частой передаче по материнской линии в какой-то из ветвей рода.

Какой бы ни была верная этимология — от шелухи или от луга — прозвище Лухта закрепилось за человеком как наиболее употребительное именование, а со временем легло в основу фамилии, которая передавалась из поколения в поколение, по сей день храня память о происхождении человека.