Фамилия Лухтины образована от прозвища Лухта, и её происхождение неоднозначно. Самая прямая версия связывает прозвище с белорусским словом «лухта» — шелуха. В этом случае Лухтой могли назвать человека, занятого в производстве круп: чисткой гречи или проса, отделением зерна от шелухи. Прозвище давалось по ремеслу и закреплялось за потомками. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — «Лухтин», то есть сын или потомок Лухты.

Вторая гипотеза выводит прозвище из эстонского luht — «луг». Тогда Лухта — человек, живший у большого луга или на заливных лугах. Это объяснение географическое: прозвище указывало на место жительства, а не на занятие. Эстонский корень не случаен: фамилия встречается на северо-западе России, в регионах, где исторически были контакты с прибалтийско-финским населением.

Обе версии имеют право на существование, но первая — ремесленная — выглядит убедительнее: прозвища по роду деятельности давали чаще, чем по ландшафту, и они лучше закреплялись в фамилиях. Однако без конкретных записей по каждой ветви рода утверждать что-то наверняка нельзя. Фамилия Лухтины — не массовая, а потому её носителям стоит искать корни в локальных архивах тех губерний, где фамилия фиксируется в XIX веке, особенно в псковских и новгородских землях.