Фамилия Лукпонькин — редкий пример, в котором славянская словообразовательная модель накладывается на основу, явно не славянского происхождения. Если отбросить суффикс -ин (указывающий на принадлежность: «чей?» — Лукпонькин, то есть сын или потомок Лукпоньки), то в корне остаётся странное слово «лукпоньк-». В русском языке такого слова нет, и это сразу подсказывает направление поиска.

Скорее всего, перед нами фамилия, возникшая на стыке культур, скорее всего, в Поволжье или Приуралье. Основа «Лукпоньк-» с большой вероятностью происходит от мордовского (эрзянского или мокшанского) имени или прозвища. В мордовской антропонимии распространены имена, начинающиеся на «Лук-», например, Лукьян (заимствованное через православие) или местные варианты. Вторая часть «-поньк-» может восходить к мордовскому слову «понкс» — «нитка», «верёвка», либо к «понгс» — «гриб». Таким образом, Лукпонька могло быть внутрисемейным прозвищем вроде «Лукьянова нитка» или «луковый гриб» — странно звучит по-русски, но для мордовской деревни XIX века это было понятное бытовое имя, данное по какой-то заметной черте или случаю.

Русский суффикс -ин и окончание, типичное для фамилий центральной России, указывают, что носители фамилии жили в зоне активного смешения русского и финно-угорского населения. Фамилия могла оформиться, когда мордвин по имени Лукпонька попал в русскую перепись или в рекруты, и его записали по отцу как Лукпонькин. Других версий, например, связи с украинским или белорусским языком, нет — там такой основы не встречается. Лингвистически фамилия уникальна тем, что сохранила в неизменном виде редкую мордовскую лексему, которая в самой мордовской среде уже могла исчезнуть. Сведений о сословной принадлежности первых носителей нет, но судя по модели образования, это крестьянская фамилия, зафиксированная не ранее конца XVIII — начала XIX века.