Фамилия Луконкин — один из тех случаев, когда прозвище, лёгшее в основу, напрямую связано с растением, но не с тем, которое сразу приходит на ум. Вопреки ожиданию, корень здесь не «лук» в значении «оружие» или «огородное растение», а «луконька» — уменьшительно-ласкательная форма слова «лукно». Лукно — это старинная плетёная корзина или лукошко, которую на Руси использовали для сбора ягод, грибов, хранения зерна или мелкого товара.

Модель образования типична для русских фамилий: основа «Луконк(а)» плюс суффикс притяжательности -ин, указывающий на принадлежность. Луконкин буквально означал «сын Луконьки» или «человек из семьи Луконьки». Само прозвище Луконька мог получить корзинщик — мастер, плевший лукошки, либо торговец, носивший товар в таком коробе, или просто человек, примечательный тем, что постоянно ходил с лукошком. В русских говорах слово «луконька» бытовало повсеместно, поэтому фамилия не привязана к одной узкой области, хотя чаще встречается в северных и центральных регионах, где плетение из бересты и лыка было особенно развито.

Редкий суффикс -к- в прозвищной основе (Луконька вместо Луконя) делает фамилию отличительной. Сравните с однокоренными Луконяев, Луконин — они образованы от более полных форм имени или прозвища. Луконкин же сохранил именно уменьшительный, почти ласкательный оттенок, характерный для бытовой речи. В документах XVII–XVIII веков такие прозвища фиксировались как именования крестьян и посадских людей, но не дворян, что указывает на простое, ремесленное или крестьянское происхождение большинства носителей. Фамилия не попала в списки столбового дворянства и не обросла легендами о знатных предках — её история уходит корнями в повседневный труд и меткое народное слово.