Фамилия Лукшите — редкий случай для русского ономастикона. Она не вписывается в привычные модели на -ов, -ин или -ский, а её окончание -ите сразу указывает на литовское происхождение. В литовском языке суффикс -ите (-ytė) — это типичный патронимический (по отцу) или родовой показатель для женщин, то есть Лукшите буквально означает «дочь Лукаса» или «из рода Лукаса». Мужской аналог такой фамилии звучал бы как Лукша или Лукшис.

Основа Лукш- восходит к литовскому личному имени Lukas — аналогу русского имени Лука, которое в свою очередь происходит от латинского lux («свет»). В Литве и исторических землях Великого княжества Литовского фамилии с таким корнем встречаются в формах Lukša, Lukšys, Lukšas. Форма Лукшите, скорее всего, закрепилась за женщиной в документах Российской империи или советского времени, когда литовские фамилии записывали по-русски, сохраняя «женское» окончание.

Географически фамилия почти наверняка привязана к западным регионам: Литве, Калининградской области или западной Беларуси. В русской среде она не могла возникнуть самостоятельно — это результат русификации литовской фамилии при переезде или в ходе административного учёта. Суффикс -ите в русском языке не продуктивен, поэтому носительница фамилии Лукшите почти наверняка имеет литовские корни по прямой женской линии.

Интересная деталь: в отличие от большинства фамилий, которые «застывают» в мужском роде, Лукшите сохраняет грамматический род — она не склоняется как типичная русская фамилия, а остаётся неизменяемой. Это роднит её с польскими фамилиями на -ич или украинскими на -енко, но с той разницей, что здесь мы видим не славянскую, а балтскую модель словообразования. Если предки носительницы фамилии жили в Литве до XIX века, они могли принадлежать к крестьянскому сословию — именно в этой среде патронимические фамилии на -ите были особенно распространены.