Фамилия Лунеговы (в мужском варианте — Лунегов) образована от нецерковного имени или прозвища Лунега. Самая обоснованная версия связывает эту основу с коми-пермяцким словом «лунея», что означает «дневной». Скорее всего, так называли ребёнка, родившегося днём. Это объяснение выглядит правдоподобным, потому что мирские имена, данные по времени рождения (Утро, Вечер, День), — распространённая практика в финно-угорской и севернорусской традиции именования.

Существует и другая версия, но она заметно слабее. Согласно ей, прозвище Лунега восходит к глаголу «лунуть» — «стрелять». Если это так, то прозвище мог получить удачливый охотник. Однако связь с коми-пермяцким корнем выглядит убедительнее, учитывая географию бытования фамилии: Лунеговы — типичная фамилия для Пермского края и соседних территорий, где исторически живут коми-пермяки.

Ещё одна гипотеза, которую обычно упоминают, но без серьёзных оснований, — связь со словом «лунить» (хлопать глазами). Якобы так могли назвать невнимательного человека или «моргуна». Но эта версия не подкреплена ни диалектными данными, ни историческими записями, поэтому её можно оставить лишь как курьёз.

Словообразовательная модель фамилии проста: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?»). Лунегов буквально означает «сын Лунеги». Это типичная патронимическая фамилия, каких много на Русском Севере и в Приуралье.

Точное время возникновения фамилии неизвестно, но процесс её оформления шёл в XV–XVII веках, когда у крестьян и посадских людей появлялись наследственные прозвания. Фамилия Лунегов — не дворянская, а народная, и её корни уходят в дохристианские, языческие по происхождению имена. В этом её ценность как памятника местной культуры и языка.