Основой фамилии Лунегов послужило мирское имя Лунега. Фамилия Лунегов образована от нецерковного имени Лунега. Оно имеет коми-пермяцкое происхождение и образовано от слова «лунея» - «дневной». Очевидно, так называли ребенка, родившегося днем. Согласно другой, менее правдоподобной версии, в основе этой фамилии лежит прозвище Лунега, восходящее к глаголу «лунуть» - «стрелять». Возможно, так называли удачливого охотника. Нельзя также исключить связь этой фамилии со словом «лунить» - «хлопать глазами». В этом случае прозвище Лунега мог получить моргун или невнимательный человек. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Лунега, со временем получил фамилию Лунегов.