Фамилия Лупейките звучит не по-русски, и это верная подсказка: перед нами типичная литовская фамилия. Её окончание -ите (-ytė) — один из главных опознавательных знаков литовской ономастики. В Литве женские фамилии образуются от мужских с помощью суффиксов -aitė, -ytė, -utė, указывающих на незамужнюю женщину, дочь. Лупейките, таким образом, означает «дочь (или девушка) Лупейкиса». Мужская форма — Лупейкис (Lupeikis).

Основа фамилии — литовское слово lupa, lupė, что значит «кора» или «лыко». В старину лыко (липовое, берёзовое) шло на плетение лаптей, коробов, мочалок. Прозвище Лупе или Лупейка мог получить человек, занимавшийся заготовкой лыка, плетением лаптей, либо же тот, у кого была грубая, обветренная, как кора, кожа. Встречается и другая версия: lupa в литовских говорах могло означать «обдирала», «шкуродёр» (в переносном смысле — человек, дерущий непомерную плату). Однако корень, связанный с лыком и корой, более распространён и бытово понятен.

Фамилии с основой Lup- (Лупа, Лупас, Лупейка) встречаются не только в Литве, но и на северо-западе Беларуси и в бывшей Сувалкской губернии, где исторически жили литовцы. Русская традиция могла переделать Лупейкиса в Лупейкина, но исходная форма Лупейките — чисто литовская, женская, и в русском контексте почти не склоняется по падежам (кроме родительного: Лупейките). В современных документах носительница такой фамилии, скорее всего, литовка или происходит из литовской семьи, сохранившей национальную форму фамилии даже при жизни в России.

Итак, фамилия Лупейките происходит от прозвища, связанного с лыком или корой, и указывает на предка-мужчину, которого звали Лупейкис. Это редкий для России случай, когда фамилия сохранила не только корень, но и живой грамматический род литовского языка.