Фамилия Лушинина — женская форма от мужской Лушинин, и её происхождение напрямую связано с именем или прозвищем Луша. В русской ономастике это краткая, уменьшительная форма от целого ряда крестильных имён: Лука (через Лукьян), Лукий, а также от Галактион (в народном произношении Лактион, Лакион, Луша). Поэтому первая и самая вероятная версия: предок носителя фамилии был человеком по имени Лука, которого в быту звали Луша, а его дети и потомки пошли по отчеству — Лушины, то есть «чьи? — Лушины». Суффикс -ин указывает на принадлежность: Лушинин буквально значит «сын Луши».

Менее распространённая, но возможная гипотеза связывает основу с диалектным глаголом «лушить» — в некоторых говорах это означало «шелушить», «очищать от скорлупы», а также «бить, колотить». В таком случае прозвище Луша мог получить человек, занятый лущением зерна или орехов, либо, в переносном смысле, драчун. Однако для фамилий на -ин, образованных от прозвищ на -а, характерна именно антропонимическая основа (личное имя или уменьшительное), а не нарицательная, так что версия с именем Лука выглядит убедительнее.

Интересная деталь: фамилия Лушинин (и её женская форма) встречается в основном в центральных и северных областях России — в Вологодской, Костромской, Ярославской губерниях. Это не случайно: именно там были особенно популярны уменьшительные формы имён на -ша (Гриша, Федяша, Луша). В других регионах, например в южнорусских, того же Луку чаще называли Лукьянкой или Лукашей, а не Лушей. Таким образом, по фамилии можно примерно определить, откуда родом были предки: скорее всего, из северной или средней полосы.

Социальный состав носителей фамилии был пёстрым: в переписных книгах XVII–XVIII веков Лушинины значатся и среди крестьян, и среди посадских людей, и среди однодворцев. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано — это типичная «народная» фамилия, образованная от бытового имени. В написании иногда встречается вариант с одной «н» — Лушина, но это уже другая фамилия, образованная от той же основы, но с другим суффиксом.