Фамилия Лушин образована от имени Луша — просторечной, производной формы женского имени Лукерья. Церковная форма этого имени — Гликерия, что в переводе с греческого означает «сладкая». Покровительницей имени считается святая Гликерия Гераклейская: она мученически пострадала за веру во II веке, в правление императора Антонина (138–161). В Православной церкви день её памяти отмечают 22 октября (4 ноября по новому стилю).

По словообразовательной модели фамилия относится к типично русскому типу на -ин. Этот суффикс указывает на принадлежность: Лушин — «чей?» — сын или потомок Луши. В крестьянской среде фамилии на -ин часто давали по имени матери, особенно если женщина была главой семьи или её имя было более употребительным, чем отчество. Так что предок современного Лушина мог быть сыном женщины по имени Луша (Лукерья).

Возможен и другой, менее очевидный вариант происхождения: основа «луш-» могла быть связана с диалектным словом. В некоторых говорах «луша» означало «лужа» или «болотистое место». Тогда фамилия могла закрепиться за человеком, жившим у воды, — как прозвище, перешедшее в наследственное имя. Однако эта версия уступает первой по распространённости: подавляющее большинство носителей фамилии Лушин восходят к женскому имени, а не к географическому признаку.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Лушев, Лушаков, Лушинский — подтверждает, что ядро здесь именно личное имя, а не нарицательное слово. В русском ономастиконе фамилии, образованные от уменьшительных форм женских имён (Машин, Танин, Дунин), встречаются реже, чем от мужских, и потому выделяются на общем фоне. Фамилия Лушин — один из таких редких случаев, когда в основе лежит имя женщины, а не мужчины-родоначальника.